本方向立足于云南丰富的地方畜禽资源，开展了地方畜禽遗传资源发掘与评价，致力于揭示畜禽遗传资源的特性及其遗传机理，构建了畜禽资源高效利用的模式，丰富和完善现代动物遗传育种理论，在地方畜禽选育和遗传资源发掘与评价方面形成了鲜明的研究特色。

本方向如下五个研究领域：

研究领域之一：乌骨绵羊基因高效发掘与鉴定

研究领域之二：高原动物抗逆性状多组学发掘

研究领域之三：抗病性状动物模型构建及评价

研究领域之四：地方畜禽基因资源发掘与利用

研究领域之五：动物基因组编辑及体细胞克隆